Mientras que en la superficie, Yuu Otosaka parece ser solo otro adolescente encantador e inteligente, tiene un secreto: tiene la capacidad de deslizarse en la mente de las personas y controlar completamente su cuerpo durante cinco segundos a la vez. Yuu ha estado usando esta habilidad durante años para obtener las calificaciones más altas, lo que le permitió ingresar a una prestigiosa escuela secundaria.

Cuando el enigmático Nao Tomori atrapa a Yuu usando su poder, ella lo obliga a él y a su hermana Ayumi a transferirse a la Academia Hoshinoumi, una escuela para estudiantes con habilidades sobrenaturales. El consejo estudiantil de la escuela, dirigido por Nao, tiene la tarea de rastrear en secreto a los adolescentes que abusan de sus poderes.

Yuu se ve obligado a unirse al consejo estudiantil y juntos se enfrentan a desafíos formidables que lo acercan a la sorprendente verdad de que su propia habilidad, aparentemente incompleta, podría ser más poderosa de lo que podría haber imaginado.Una historia original de Jun Maeda, creadora de Angel Beats y Clannad, Charlotte explora la vida sobrenatural de estos adolescentes y el precio que deben pagar por ser especiales.